在死期將至的人類肉體中植入種子，使其轉變為植物的技術——「轉花」。那是人類為了延續生存所選擇的手段。厚重烏雲遮蔽天空、只剩下冬天與黑夜的遙遠未來地球——絕大多數植物早已枯萎殆盡，陷入氧氣不足的人類，建立起依賴「轉花」所產生微量氧氣的社會。飽受貧困所苦的青年神谷十四郎（神谷トーシロー），為了稅金、生活費以及罹患精神疾病母親的醫藥費而拚命工作。然而，殘酷的現實，卻一點一點地奪走了他的希望。——活著……連一件開心的事都沒有——在這個沒有光的世界裡，他所選擇的道路，是成為由人類

原本被當成謠言的都市傳說，一個接一個化為現實……戴著紅色兜帽的少年千野不思議（暫譯），為了將具現化的都市傳說收進自己的手帳中，正在各地旅行。而他的目的，是抓住能讓都市傳說具現化的少女——秘密（暫譯）。不思議與搭檔人面犬吉米（暫譯）一同挑戰接連發生的怪奇現象，一步步逼近秘密。究竟，這場少年與少女的追逐戲碼，最終將走向何方——

获得「魔法王国」所赐之魔力、每日勤奋奔走于助人的魔法少女们——她们收到了来自神秘寄信人所寄出，名为『魔法少女育成计划』的游戏邀请函。受到隐藏着死亡风险、毫无逻辑可言的游戏所囚禁的十六位魔法少女，在幕后黑手策划的诡计玩弄下，开始为了存活下来而绞尽脑汁苦思对策……