經歷京都與練馬的殊死激戰後，四季等羅剎學園的學生們開始逐漸成長。無陀野打算教導他們同伴的重要性，但矢颪對此卻不以為然，反而認同鬼國隊首領等等力颯提出的「徹底消滅桃」的理念，最終離開了羅剎學園。鬼國隊的信條是連同非戰鬥人員在內格殺勿論，意識到這一點的四季開始與無陀野和同學們一同追捕矢颪。他們此行的目的地是日光。不久前，華嚴瀑布乾涸，取而代之的是一座巨型研究所。在那裡，正不斷開展著駭人聽聞的實驗……

「你繼承了鬼的血統……」「鬼」與「桃太郎」的血脈，在部分人類之間代代相傳。很久以前，因自覺自身兇暴，「鬼」們選擇過著隱密的生活。然而，「桃太郎」卻對他們發動了進攻。雙方各自組成「桃太郎機關」與「鬼機關」，展開延續數千年的對立。在突如其來的襲擊中，主人公・一之瀨四季得知自己身懷鬼之血。當他與棲息於血中的「鬼」相遇，四季的宿命將迎來何種結局————新世代黑暗英雄的「鬼」之傳說，即將揭幕！