19年前，世界因神秘敵人「蟲」的攻擊陷入崩壞狀態。各國將戰力都集結到西伯利亞與敵人展開決戰，流龍馬他們乘坐的蓋特機器人也在其中。直到現在戰鬥還沒有結束，在日本淺間山腳下的早乙女研究所的隼人收到蓋特D2有所行動的情報，而駕駛著它的陌生年輕人自稱是「流拓馬」？蓋特D2一瞬間直衝天際與敵方激烈交戰！隼人命令正在待機的駕駛員神威匠駕駛蓋特ARC出擊！在這場戰役的盡頭等待的，是生存還是滅亡？